KoÅ›cióÅ‚ p.w. Å›w. Anny wzniesiono w Kodniu pod koniec XVI w. Erekcja parafii rzymskokatolickiej nastÄ…piÅ‚a okoÅ‚o roku 1520. Ten drewniany koÅ›cióÅ‚ Å›w. Anny spÅ‚onÄ…Å‚ w 1680 r. W latach 1624 – 1646 staraniem MikoÅ‚aja Sapiehy oraz Kazimierza Sapiehy – jego nastÄ™pcy, wybudowano murowanÄ… Å›wiÄ…tyniÄ™ pod tym samym wezwaniem. Za sprawÄ… również Kazimierza Sapiehy frontowa wieża zostaÅ‚a rozszerzona o boczne skrzydÅ‚a.

KoÅ›cióÅ‚ poÅ›wiÄ™cono 1686 roku. Niepowtarzalnego charakteru nadaje Å›wiÄ…tyni barokowa, parawanowa fasada, która zostaÅ‚a ostatecznie zakoÅ„czona przez Jana Fryderyka SapiehÄ™ na poczÄ…tku XVIII wieku.
W 1865 r. rzÄ…d carski skonfiskowaÅ‚ dobra parafii kodeÅ„skiej, usuwajÄ…c pracujÄ…cych tu kapÅ‚anów, za wyjÄ…tkiem jednego. Dziesięć lat później aresztowano i osadzono w twierdzy brzeskiej, apotem wywieziono w gÅ‚Ä…b Rosji kodeÅ„skiego proboszcza ks. Tytusa Zegarta. Potem wydarzenia nabraÅ‚y pÄ™du. KoÅ›cióÅ‚ Å›w. Anny, Å›w. Ducha i Å›w. WawrzyÅ„ca zostaÅ‚y z dniem 6 kwietnia 1875 r. przekazane na rzecz cerkwi prawosÅ‚awnej. Tegoż roku prawosÅ‚awni pozbawili Å›wiÄ…tyniÄ™ Å›w. Anny wyposażenia oraz zmieniony zostaÅ‚ ksztaÅ‚t wież na Å›wiÄ…tyni na prawosÅ‚awne kopuÅ‚y. Zlikwidowano parafiÄ™ w Kodniu, przyÅ‚Ä…czajÄ…c jÄ… do parafii w Huszczy. Wtedy też wywieziono obraz M.B. KodeÅ„skiej na JasnÄ… GórÄ™ do CzÄ™stochowy. Dopiero w latach 20-tych koÅ›cióÅ‚ wróciÅ‚ do dawnego wyglÄ…du.

W 1920 roku przywrócono w Kodniu parafiÄ™. Dekretem z 25 maja 1927 roku parafiÄ™ przejÄ™li Misjonarze Oblaci Maryi niepokalanej. NiespeÅ‚na dwa miesiÄ…ce później do Kodnia powróciÅ‚ cudowny obraz M.B. KodeÅ„skiej, przywieziony przez bpa Przeździeckiego. Jeszcze przed II wojnÄ… Å›wiatowÄ… sprowadzono dawny oÅ‚tarz, wywieziony do Opinogóry. Lata II wojny Å›wiatowej oszczÄ™dziÅ‚y sanktuarium, mimo uszkodzeÅ„ murów i dachu Å›wiÄ…tyni. Po wojnie Misjonarze Oblaci odremontowali koÅ›cióÅ‚.
Biskup podlaski majÄ…c na uwadze znaczenie Å›wiÄ…tyni jako miejsca kultu maryjnego zwróciÅ‚ siÄ™ do Stolicy apostolskiej z proÅ›ba o podniesienie rangi koÅ›cioÅ‚a do godnoÅ›ci Bazyliki Mniejszej.  Poza Rzymem, gdzie znajdujÄ… siÄ™ bazyliki wiÄ™ksze, wszystkie inne na Å›wiecie noszÄ… nazwÄ™ bazylik mniejszych. TytuÅ‚ bazylika oznacza  koÅ›cióÅ‚ papieski. Taki też tytuÅ‚ nadaÅ‚ Papież PaweÅ‚ VI koÅ›cioÅ‚owi Å›w. Anny w Kodniu 19 maja 1973 roku.    

Okres powojenny to wiele ważnych wydarzeÅ„ w Å¼yciu parafii. Oto niektóre z nich. Rok 1969 to 150-lecie istnienia diecezji siedleckiej. MszÄ™ Å›w. celebrowaÅ‚ wówczas Metropolita Krakowski abp Karol WojtyÅ‚a a kazanie wygÅ‚osiÅ‚ Prymas Polski ks. KardynaÅ‚ Stefan WyszyÅ„ski. Rok 1977 to 50-lecie powrotu cudownego obrazu M.B. KodeÅ„skiej do Kodnia. UroczystoÅ›ciom przewodniczyÅ‚ KardynaÅ‚ Karol WojtyÅ‚a. Potem byÅ‚ 1981 rok i 350-lecie pobytu obrazu M.B. KodeÅ„skiej na Podlasiu oraz 1998 – 275-lecie koronacji obrazu.

W 2002 roku obchodzono 75-lecie objÄ™cia parafii przez Misjonarzy Oblatów.